產(chǎn)品介紹：

最短的時間內(nèi)獲得答案，智能化的工作流程，廣泛的測序應(yīng)用范圍     

 Illumina公司推出的MiSeq是目前唯一一臺在單個儀器上整合了擴(kuò)增、測序和數(shù)據(jù)分析的新一代測序儀，每次運(yùn)行能產(chǎn)生超過1 Gb的數(shù)據(jù)，且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq有著革命性的流程和無可比擬的準(zhǔn)確性，這讓它成為快速且經(jīng)濟(jì)高效的遺傳分析的理想平臺，適合廣泛的應(yīng)用。同時根據(jù)Illumina的最新消息，今年9月份左右，MiSeq系統(tǒng)的測序通量將會升級至7G左右。升級將通過兩個方面完成，一個是cluster密度的增大，升級后cluster密度將會增加至12-15million，而pair-end讀取的reads數(shù)目將會增加至24-30million；另一方面是通過測序讀長而提升通量，屆時測序讀長會達(dá)到2*250bp，同時測序速度也會有所提升。目前，Broad研究院已經(jīng)利用現(xiàn)有試劑實現(xiàn)了單端測序300bp讀長，Illumina目前內(nèi)部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序。而這些，都是保證在高質(zhì)量數(shù)據(jù)結(jié)果的前提下完成的。

MiSeq性能參數(shù)

 1.技術(shù)規(guī)格

▲1.1高數(shù)據(jù)通量：每輪反應(yīng)最高可生成15G的有效數(shù)據(jù)；通量可以根據(jù)不同要求調(diào)整；

1.2每次運(yùn)行可生成可讀2500萬個測序片段標(biāo)簽序列；

1.3每輪實驗運(yùn)行成本：測序150億（15G）個堿基對所需成本不高于2000美元；成本包含了從樣本前期建庫-克隆擴(kuò)增-測序-數(shù)據(jù)分析的所有成本；

▲1.4有效數(shù)據(jù)讀長：單端讀取序列，讀長可達(dá)300個堿基；雙端讀取序列：讀長可達(dá)2x300個堿基 。讀長可根據(jù)不同的應(yīng)用而調(diào)整；

▲ 1.5 拼接前原始數(shù)據(jù)質(zhì)量評判采用的測序質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)為Q30，并且高于Q30的堿基比例是整個運(yùn)行的平均結(jié)果；

▲1.6實驗流程:樣本文庫制備只需要90分鐘。之后在同一系統(tǒng)中直接開展自動克隆擴(kuò)增－測序－數(shù)據(jù)分析。整個過程不需要繁瑣的emulsion 實驗，人工干預(yù)的時間少于1小時；

▲1.7無需單獨(dú)的擴(kuò)增設(shè)備，所有樣本的克隆擴(kuò)增, 測序到數(shù)據(jù)分析都在同一臺儀器中自動完成，無需人工干預(yù)；

1.8 多重擴(kuò)增子測序的每次反應(yīng)最多可同時檢測384個樣本，每個樣本可同時分析1536條產(chǎn)物?？筛鶕?jù)不同實驗需要選擇樣本通量；

1.9 廠家能夠提供商品化的應(yīng)用試劑供用戶日常選擇使用，比如：

     檢測自閉癥的試劑；

     檢測靶向主要是針對生殖細(xì)胞存在的與腫瘤相關(guān)基因的試劑；

     檢測遺傳性疾病的試劑，能夠重點(diǎn)關(guān)注嬰幼兒早期嚴(yán)重的、隱形遺傳??；

  1.10 儀器具備以下軟件分析功能：

?      全基因組重測序

?      定向重測序，包括但不限于下列方法：

o     TruSeq 自定義捕獲

o     TruSeq 自定義擴(kuò)增子測序

o     長距離片段

o     分子倒置探針

?      De novo 測序

?      序列特異DNA結(jié)合蛋白的ChIP-Seq

?      組蛋白修飾和表觀遺傳標(biāo)記的ChIP-Seq

?      亞硫酸氫鹽處理DNA的測序，DNA甲基化研究

?      宏基因組學(xué)研究

?      mRNA測序

?      基于標(biāo)簽的基因表達(dá)

?      小RNA測序

?      核糖體圖譜分析

?      DNase I 超敏位點(diǎn)定位研究

?      核小體定位和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)研究研究

?      CLiP-Seq：研究序列特異的蛋白-RNA相互作用研究

?      CNV-Seq：用測序測定拷貝數(shù)變異研究

?      GRO-Seq：研究RNA聚合酶起始研究

?      降解DNA樣品的測序

?      末端配對mRNA測序

?      DNA印跡和等位基因特異的表達(dá)

2配置要求

2.1能符合上述指標(biāo)的測序系統(tǒng)主機(jī)1套,包括了樣本文庫自動擴(kuò)增和數(shù)據(jù)分析功能；儀器控制服務(wù)器配置：Intel Core i7-2710GE 2.10GHz CPU，16GB RAM，750G硬盤，采用Win7 Embedded Standard操作系統(tǒng)；

2.2 96孔磁力架

2.3 核酸蛋白定量儀Qubit

2.4配套控制軟件；

2.5 配套分析報告軟件：開展完整的數(shù)據(jù)分析無需用戶干預(yù)，從質(zhì)量打分的堿基檢出到變異體檢出和比對所需時間小于4小時；

2.6 相關(guān)儀器調(diào)試用試劑；

2.7 必需的附件、配件及專用工具等；

3.技術(shù)文件

3.1儀器操作使用手冊；

3.2儀器維護(hù)的有關(guān)資料；

 工作流程

4大特性
1、最短的實驗周期：從樣品制備開始只需要8小時即可得到超過100M的高質(zhì)量測序結(jié)果。
2、最便捷的樣品制備流程：只需50ngDNA模板，2小時的自動化操作就可以完成全部樣品制備工作。
3、最精確的測序原理：MiSeq繼續(xù)GA和HiSeq平臺的邊合成邊測序的化學(xué)原理，數(shù)千篇高質(zhì)量的國際期刊文章是對Illumina NGS平臺測序結(jié)果可信度最有力的證明。
4、最完整的整合功能：MiSeq可以獨(dú)立完成簇生成，雙向測序及數(shù)據(jù)分析工作，讓經(jīng)費(fèi)和實驗室空間不再成為NGS研究的障礙。

應(yīng)用范圍
1、轉(zhuǎn)錄組測序
派森諾MiSeq測序平臺是基因組已測序物種的轉(zhuǎn)錄組分析最佳平臺。公司技術(shù)團(tuán)隊目前已完成了包括斑馬魚在內(nèi)的多種植物、動物的轉(zhuǎn)錄組測序及分析。
2、宏基因組16S rDNA單V區(qū)測序
對16s rDNA的單V區(qū)(V3\V4)進(jìn)行高通量測序，鑒定細(xì)菌群和古生菌群。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區(qū)并結(jié)合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區(qū)成功的對雞的腸道環(huán)境細(xì)菌進(jìn)行了鑒定。
3、Small RNA測序
1*35bp的讀長完美地配合了小RNA的測序長度，速度快，靈敏度高。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊目前已完成了鵝的小RNA測序和多種中草藥的小RNA測序。

4、重測序：

包括全基因組重測序、簡化基因組測序、外顯子測序。
Illumina MiSeq非常適用于對微生物基因組的重測序，每次運(yùn)行即可完成一個微生物基因組測序。2011年12月27日，派森諾的技術(shù)團(tuán)隊利用MiSeq一次運(yùn)行同時完成了乳酸菌
（Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8）的重測序，基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍，比對至參考序列，基因組覆蓋率為100%，同時檢測到了多種結(jié)構(gòu)變異，包括插入、缺失和SNP位點(diǎn)，并且檢測到了全部質(zhì)粒。